Lapintiira on erityisesti ulkosaariston yksi tyypillisimmistä pesimälajeista. Se pesii pääsääntöisesti suurina kymmenien-satojen parien muodostamina yhdyskuntina. Pesä on tyypillisesti vain maahan hiekalle potkittu matala kuoppa, johon munitaan 1-3 munaa. Munat ovat pääsääntöisesti täplikkäitä ruskean tai harmaan kirjavia, mutta ei ole epätavallista etteikö joukossa olisi välillä aivan puhtaan valkoisiakin munia. Tiirat saapuvat pääsääntöisesti toukokuussa ja lähtevät heinä-elokuussa. Talven ne viettävät Etelä-Afrikan ja Etelämantereen välisillä vesialueilla noin 10000 kilometrin päässä pesimäseudultaan. Sisämaan järvillä laji pesii hyvin harvoin.